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微波綠豆殺菌干燥設備是將被加熱物料本身作為發熱體，微波熟化烘烤作用可以瞬時深入到物料內部，使物料內外同時受熱，不需要熱傳導的過程，所以溫升極快，大大縮短了加熱時間，所需時間一般為常規方法的1/4左右。 綠豆微波熟化烘烤設備同樣具有殺菌的功能，微波殺菌機主要包括熱效應理論和非熱效應理論。熱效應理論認為微波具有高頻特性，當它穿透介質時，水、蛋白質、核酸等極性分子受交變電場的作用而取向運動，相互摩擦產生熱量，從而導致溫度升高，使微生物的蛋白質、核酸分子改性或失活，從而殺滅微生物。非熱效應理論主要有細胞膜離子通道模型和蛋白質變性模型。前者認為微波對細菌的生物反應是微波電場改變細胞膜斷面的電子分布，影響細胞膜周圍電子和離子濃度，從而改變細胞膜的通透性能，細菌因此不能正常代謝，細菌結構功能紊亂。后者認為，微生物中的蛋白質、核酸物質和水等極性分子在高頻率、強電場的微波場中隨著微波極性的改變而引起蛋白質分子團的旋轉或振動，使其蛋白質分子變性，從而達到殺菌目的。
