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1、時間短、速度快
常規熱力殺菌是通過熱傳導，對流或輻射等方式將熱量從食品表面傳至內部。要達到殺菌溫度，往往需要較長時間。微波殺菌是微波能與食品及其細菌等微生物直接相互作用，熱效應與非熱效應共同作用，達到快速升溫殺菌作用，處理時間大大縮短，各種物料的殺菌作用一般在3-5分鐘。
2、低溫殺菌保持營養成份和傳統風味
微波殺菌是通過特殊熱和非熱效應殺菌，與常規熱力殺菌比較，能在比較低的溫度和較短的時間就能獲得所需的消毒殺菌效果。實踐表明，一般殺菌溫度在75-80℃就能達到效果，此外，微波處理食品能保留更多的營養成份和色、香、味、形等風味，且有膨化效果。如常規熱力處理的蔬菜保留的維生素C是46-50%，而微波處理是60-90%，常規加熱豬肝維生素A保持為58%，而微波加熱為84%。
3 、節約能源
常規熱力殺菌往往在環境及設備上存在熱損失，而微波是直接對食品進行作用處理，因而沒有額外的熱能損耗。此外，其電能到微波能的轉換效率在70-80%，相比而方，一般可節電30-50%。
4、均勻徹底
常規熱力殺菌是從物料表面開始，然后通過熱傳導傳至內部。存在內外溫差。為了保持食品風味，縮短處理時間，往往食品內部沒有達到足夠溫度而影響殺菌效果。由于微波具有穿透作用，對食品進行整體處理時，表面和內部都同時受到作用，所以消毒殺菌均勻、徹底。
5、便于控制
微波食品殺菌處理，設備能即開即用，沒有常規熱力殺菌的熱慣性，操作靈活方便，微波功率能從零到額定功率連續可調、傳輸速度從零開始連續調整，便于控制。
6、設備簡單，工藝先進
與常規消毒殺菌相比，微波殺菌設備，不需要鍋爐，復雜的管道系統，煤場和運輸車輛等，只要具備水、電基本條件即可。
7、改善勞動條件，節省占地面積
設備的工作環境溫度低、噪音小，極大地改善了勞動條件。整套微波設備的操作人員只需2-3人。廣泛用于木耳、人參、鮮花、蔥姜蒜片。棗片、辣椒、脫水蔬菜、豆制品等制品的熱化、干燥和殺菌，通過微波殺菌和保鮮技術，不但不會破壞物料原有的營養成分，衛生指標完全可低于食品衛生標準，完全可以達到食品的出口級標準，同時大大延長食品的貨架期。
微波加熱原理 波是頻率從300MHz～300GMHz的電磁波，其方向和大小隨時間作周期性變化。微波與物料直接作用，將超高頻電磁波轉化為熱能的過程即為微波加熱過程。水是強烈吸收微波的物質，物料中的水分子是極性分子，在微波作用下，其極性取向隨著外電磁場的變化而變化，915MHz的微波可使水分子每秒運動18.3億次，致使分子急劇磨擦、碰撞，使物料產生熱化和膨化等一系列過程而達到微波加熱目的 微波殺菌機理 微波殺菌是微波的熱效應和生物效應共同作用的結果。微波對細菌的熱效應是使蛋白質變性，使細菌失去營養、繁殖和生存的條件而死亡；生物效應是微波電場改變細胞膜斷面的電位分布，影響細胞周圍電子和離子濃度，從而改變細胞膜的通透性能，細菌因此營養不良，不能正常新陳代謝，細菌結構功能紊亂，生長發育受到抑制而死亡。此外，決定細菌正常生長和穩定遺傳繁殖的核酸（RNA）和脫氧核糖酸（DNA），是由若干氫鍵緊密連接而成的卷曲形大分子。足夠強的微波場可以導致氫鍵松馳、斷裂和重組，從而誘發遺傳基因突變，或染色體畸變，甚至斷裂。 微波加熱主要特點： 1、加熱迅速、 微波加熱與傳統的加熱方式不同，不需熱傳導過程，它是使被加熱物料本身成為加熱體，因此即使是熱傳導性較差的物料，也可以在極短的時間內達到加熱溫度。 2、均勻 無論物體各部位形狀，它是使物料表里表里同時均勻滲透電磁波而產生熱能，不受物體形狀限制，所以加熱更均勻，不會出現外焦內生的現象 3、節能 由于含有水份的物質極易吸收微波而發熱，因此，除少量的傳輸損耗外幾乎無其它損耗。微波加熱與遠紅外加熱相比，節約能源1/3以上。 4、防霉殺菌，不破壞物料營養成分 微波加熱具有熱力效應和生物效應，因此，能在較低溫度下殺死霉菌和細菌；傳統加熱方式加熱時間較長，造成營養成分損失較大，而微波加熱迅速，能較大限度地保存物料的活性和食品中的營養成份。 5、工藝先進，可連續生產 只要控制微波功率即可實現加熱或終止。應用PLC人機界面可進行加熱工藝過程規范的可編程自動化控制，它有完善的傳送系統，可確保連續化生產，節省勞力。 6、安全無害 微波是控制在金屬制成的加熱室內工作，微波泄漏被有效抑制，不存在放射線危害及有害氣體的排放，不產生余熱和粉塵污染，極不污染實物也不污染環境。
