集裝箱按箱內所裝貨物一般分為：
（1)通用干貨集裝箱（Dry Cargo Container) 這種集裝箱也稱為雜貨集裝箱，用來運輸無需控制溫度的件雜貨。其使用范圍極廣，據1983年的統計，世界上300萬個集裝箱中，雜貨集裝箱占85％，約為254萬個。這種集裝箱通常為封閉式，在一端或側面設有箱門。 這種集裝箱通常用來裝運文化用品、化工用品、電子機械、工藝品、醫藥、日用品、紡織品及儀器零件等。這是平時常用的集裝箱。不受溫度變化影響的各類固體散貨、顆粒或粉未狀的貨物都可以由這種集裝箱裝運。
（2）保溫集裝箱（Keep Constant Temperature Container) 它們是為了運輸需要冷藏或保溫的貨物。所有箱壁都采用導熱率低的材料隔熱而制成的集裝箱可分為以下三種：
①冷藏集裝箱（Reefer Container) 它是以運輸冷凍食品為主，能保持所定溫度的保溫集裝箱。它專為運輸如魚、肉、新鮮水果、蔬菜等食品而特殊設計的。 目前國際上采用的冷藏集裝箱基本上分兩種: 一種是集裝箱內帶有冷凍機的叫機械式冷藏集裝箱；另一種箱內沒有冷凍機而只有隔熱結構，即在集裝箱端壁上設有進氣孔和出氣孔，箱子裝在艙中，由船舶的冷凍裝置供應冷氣，這種叫做離合式冷藏集裝箱（又稱外置式或夾箍式冷藏集裝箱）。
②隔熱集裝箱 它是為載運水果、蔬菜等貨物，防止溫度上升過大，以保持貨物鮮度而具有充分隔熱結構的集裝箱。通常用于冰作制冷劑，保溫時間為72小時左右。
③通風集裝箱（Ventilated Container） 它是為裝運水果、蔬菜等不需要冷凍而具有呼吸作用的貨物，在端壁和側壁上設有通風孔的集裝箱，如將通風口關閉，同樣可以作為雜貨集裝箱使用。
（3）罐式集裝箱（Tank Container） 它是專用以裝運酒類、油類（如動植物油）、液體食品以及化學品等液體貨物的集裝箱。它還可以裝運其他液體的危險貨物。這種集裝箱有單罐和多罐數種，罐體四角由支柱、撐桿構成整體框架。
（4）散貨集裝箱（Bulk Container） 它是一種密閉式集裝箱，有玻璃鋼制和鋼制的兩種。前者由于側壁強度較大，故一般裝載麥芽和化學品等相對密度較大的散貨，后者則用于裝載相對密度較小的谷物。散貨集裝箱頂部的裝貨口應設水密性良好的蓋，以防雨水侵入箱內。
（5）臺架式集裝箱（Platform Based Container） 它是沒有箱頂和側壁，甚至連端壁也去掉而只有底板和四個角柱的集裝箱。這種集裝箱可以從前后、左右及上方進行裝卸作業，適合裝載長大件和重貨件，如重型機械、鋼材、鋼管、木材、鋼錠等。臺架式的集裝箱沒有水密性，怕水濕的貨物不能裝運，或用帆布遮蓋裝運。
（6）平臺集裝箱（Platform Container） 這種集裝箱是在臺架式集裝箱上再簡化而只保留底板的一種特殊結構集裝箱。平臺的長度與寬度。與國際標準集裝箱的箱底尺寸相同，可使用與其他集裝箱相同的緊固件和起吊裝置。這一集裝箱的采用打破了過去一直認為集裝箱必須具有一定容積的概念。
（7）敞頂集裝箱（Open Top Container） 這是一種沒有剛性箱頂的集裝箱，但有由可折疊式或可折式頂梁支撐的帆布、塑料布或涂塑布制成的頂篷，其他構件與通用集裝箱類似。這種集裝箱適于裝載大型貨物和重貨，如鋼鐵、木材，特別是像玻璃板等易碎的重貨，利用吊車從頂部吊入箱內不易損壞，而且也便于在箱內固定。
（8）汽車集裝箱（Car Container） 它是一種運輸小型轎車用的專用集裝箱，其特點是在簡易箱底上裝一個鋼制框架，通常沒有箱壁（包括端壁和側壁）。這種集裝箱分為單層的和雙層的兩種。因為小轎車的高度為1．35米一1．45米，如裝在8英尺（2；438米）的標準集裝箱內，其容積要浪費2／5以上。因而出現了雙層集裝箱。這種雙層集裝箱的高度有兩種：一種為10．5英尺（3．2米），一種為8．5英尺高的2倍。因此汽車集裝箱一般不是國際標準集裝箱。
（9）動物集裝箱（Pen Container or Live StockContainer） 這是一種裝運雞、鴨、鵝等活家禽和牛、馬、羊、豬等活家畜用的集裝箱。為了遮敝太陽，箱頂采用膠合板露蓋，側面和端面都有用鋁絲網制成的窗，以求有良好的通風。側壁下方設有清掃口和排水口，并配有上下移動的拉門，可把垃圾清掃出去。還裝有喂食口。動物集裝箱在船上一般應裝在甲板上，因為甲板上空氣流通，便于清掃和照顧。
（10）服裝集裝箱（Garment Container） 這種集裝箱的特點是，在箱內上側梁上裝有許多根橫桿，每根橫桿上垂下若干條皮帶扣、尼龍帶扣或繩索，成衣利用衣架上的鉤，直接掛在帶扣或繩索上。這種服裝裝載法屬于無包裝運輸，它不僅節約了包裝材料和包裝費用，而且減少了人工勞動，提高了服裝的運輸質量